Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN5Q6U736 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
OPN5Q6U736 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN5Q6U736 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms