Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK4Q6SA08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSSK4Q6SA08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms