Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED27Q6P2C8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED27Q6P2C8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED27Q6P2C8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms