Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RRAGBQ5VZM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRAGBQ5VZM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRAGBQ5VZM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms