Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CAMSAP1Q5T5Y3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CAMSAP1Q5T5Y3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CAMSAP1Q5T5Y3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CAMSAP1Q5T5Y3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms