Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAT1Q5SQI0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAT1Q5SQI0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 681.4 ms