Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSL3PQ5NE16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSL3PQ5NE16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSL3PQ5NE16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms