Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD12Q587J7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TDRD12Q587J7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD12Q587J7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms