Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC93Q567U6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC93Q567U6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC93Q567U6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC93Q567U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms