Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP29Q52LW3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ARHGAP29Q52LW3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGAP29Q52LW3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms