Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SWI5Q1ZZU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SWI5Q1ZZU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms