Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME3Q16798 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME3Q16798 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME3Q16798 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ME3Q16798 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME3Q16798 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ME3Q16798 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ME3Q16798 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ME3Q16798 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ME3Q16798 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ME3Q16798 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ME3Q16798 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME3Q16798 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ME3Q16798 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ME3Q16798 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ME3Q16798 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ME3Q16798 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ME3Q16798 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ME3Q16798 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ME3Q16798 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ME3Q16798 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ME3Q16798 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ME3Q16798 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ME3Q16798 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ME3Q16798 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME3Q16798 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME3Q16798 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME3Q16798 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME3Q16798 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME3Q16798 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME3Q16798 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME3Q16798 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME3Q16798 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ME3Q16798 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ME3Q16798 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ME3Q16798 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ME3Q16798 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME3Q16798 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ME3Q16798 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME3Q16798 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME3Q16798 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME3Q16798 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME3Q16798 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME3Q16798 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME3Q16798 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME3Q16798 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME3Q16798 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME3Q16798 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME3Q16798 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME3Q16798 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME3Q16798 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ME3Q16798 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME3Q16798 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME3Q16798 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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