Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E2F4Q16254 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F4Q16254 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
E2F4Q16254 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms