Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPAQ15257 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPAQ15257 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPAQ15257 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPAQ15257 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPAQ15257 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPAQ15257 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPAQ15257 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPAQ15257 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPAQ15257 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPAQ15257 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPAQ15257 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPAQ15257 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPAQ15257 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPAQ15257 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPAQ15257 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPAQ15257 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPAQ15257 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPAQ15257 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPAQ15257 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPAQ15257 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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