Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TNIP1Q15025 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNIP1Q15025 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIP1Q15025 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNIP1Q15025 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
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