Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL19A1Q14993 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL19A1Q14993 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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