Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPTAN1Q13813 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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