Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BFSP2Q13515 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BFSP2Q13515 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BFSP2Q13515 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BFSP2Q13515 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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