Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAPC2Q13487 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAPC2Q13487 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNAPC2Q13487 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAPC2Q13487 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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