Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 STAG2-207ENST00000394478 676 ntTSL 53.33□□□□□ -1.881e-8■■■■■ 28.3
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ILF3Q12906 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 HNRNPK-211ENST00000493362 868 ntTSL 25.1□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 HNRNPK-208ENST00000481820 957 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 HNRNPK-210ENST00000492865 528 ntTSL 24.49□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 49.55□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 28.3
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ILF3Q12906 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)5.89□□□□□ -1.477e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.926e-7■■■■■ 28.3
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ILF3Q12906 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 56.32□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 28.2
ILF3Q12906 DPH1-216ENST00000576891 537 ntTSL 411.02□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 28.2
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ILF3Q12906 NOP16-203ENST00000503849 582 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 28.1
ILF3Q12906 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 28.1
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ILF3Q12906 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 217.95■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 28.1
ILF3Q12906 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 28.1
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ILF3Q12906 R3HDM1-208ENST00000438014 582 ntTSL 58.27□□□□□ -1.093e-8■■■■■ 28.1
ILF3Q12906 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 28.1
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ILF3Q12906 R3HDM1-219ENST00000488035 502 ntTSL 32.77□□□□□ -1.973e-8■■■■■ 28.1
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ILF3Q12906 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 28.1
ILF3Q12906 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 28.1
ILF3Q12906 MAGI2-236ENST00000637441 5822 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 28.1
ILF3Q12906 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 28
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ILF3Q12906 AURKC-201ENST00000302804 1247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 28
ILF3Q12906 AURKC-207ENST00000599062 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 28
ILF3Q12906 AURKC-202ENST00000415300 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 28
ILF3Q12906 AURKC-206ENST00000598785 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 28
ILF3Q12906 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 27.9
ILF3Q12906 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 27.9
ILF3Q12906 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 315.9■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 27.9
ILF3Q12906 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.098e-8■■■■■ 27.9
ILF3Q12906 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 59.97□□□□□ -0.816e-11■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 CUX1-219ENST00000606749 601 ntTSL 47.6□□□□□ -1.196e-11■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)19.08■□□□□ 0.648e-10■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.629e-10■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.528e-10■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.488e-10■■■■■ 27.8
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