RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504821.1

NOP16-204, Transcript of NOP16 nucleolar protein, humanhuman

TSL 5

Gene NOP16, Length 544 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16-204ENST00000504821 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.42■■■■■ 7.74
NOP16-204ENST00000504821 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.88■■■■■ 6.7
NOP16-204ENST00000504821 ABCC9O60706 1549 aa56.71■■■■■ 6.67
NOP16-204ENST00000504821 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.09■■■■■ 6.25
NOP16-204ENST00000504821 NACADO15069 1562 aa53.75■■■■■ 6.2
NOP16-204ENST00000504821 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.56■■■■■ 6.16
NOP16-204ENST00000504821 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.03■■■■■ 6.08
NOP16-204ENST00000504821 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.99■■■■■ 6.07
NOP16-204ENST00000504821 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.83■■■■■ 6.05
NOP16-204ENST00000504821 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.82■■■■■ 6.05
NOP16-204ENST00000504821 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
NOP16-204ENST00000504821 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.42■■■■■ 5.98
NOP16-204ENST00000504821 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.4■■■■■ 5.98
NOP16-204ENST00000504821 SCRIBQ14160 1630 aa51.83■■■■■ 5.89
NOP16-204ENST00000504821 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.81■■■■■ 5.88
NOP16-204ENST00000504821 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.24■■■■■ 5.79
NOP16-204ENST00000504821 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.17■■■■■ 5.78
NOP16-204ENST00000504821 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.09■■■■■ 5.77
NOP16-204ENST00000504821 NCAPD3P42695 1498 aa49.58■■■■■ 5.53
NOP16-204ENST00000504821 SMARCA4P51532 1647 aa49.45■■■■■ 5.51
NOP16-204ENST00000504821 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.44■■■■■ 5.51
NOP16-204ENST00000504821 SMARCA2P51531 1590 aa49.38■■■■■ 5.5
NOP16-204ENST00000504821 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.26■■■■■ 5.48
NOP16-204ENST00000504821 HMGXB3Q12766 1538 aa49.24■■■■■ 5.47
NOP16-204ENST00000504821 ERCC6Q03468 1493 aa49.03■■■■■ 5.44
NOP16-204ENST00000504821 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
NOP16-204ENST00000504821 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.96■■■■■ 5.43
NOP16-204ENST00000504821 CUX2O14529 1486 aa48.85■■■■■ 5.41
NOP16-204ENST00000504821 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.85■■■■■ 5.41
NOP16-204ENST00000504821 NESP48681 1621 aa48.73■■■■■ 5.39
NOP16-204ENST00000504821 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.63■■■■■ 5.38
NOP16-204ENST00000504821 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.48■■■■■ 5.35
NOP16-204ENST00000504821 WIZO95785 1651 aa48.3■■■■■ 5.32
NOP16-204ENST00000504821 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.23■■■■■ 5.31
NOP16-204ENST00000504821 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
NOP16-204ENST00000504821 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.15■■■■■ 5.3
NOP16-204ENST00000504821 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.11■■■■■ 5.29
NOP16-204ENST00000504821 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.9■■■■■ 5.26
NOP16-204ENST00000504821 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.76■■■■■ 5.24
NOP16-204ENST00000504821 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
NOP16-204ENST00000504821 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.62■■■■■ 5.21
NOP16-204ENST00000504821 WDR62O43379 1518 aa47.61■■■■■ 5.21
NOP16-204ENST00000504821 CFTRP13569 1480 aa47.57■■■■■ 5.21
NOP16-204ENST00000504821 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.56■■■■■ 5.2
NOP16-204ENST00000504821 PRDM2Q13029 1718 aa47.17■■■■■ 5.14
NOP16-204ENST00000504821 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.15■■■■■ 5.14
NOP16-204ENST00000504821 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
NOP16-204ENST00000504821 OSCARQ8IYS5 282 aa46.68■■■■■ 5.06
NOP16-204ENST00000504821 TOPBP1Q92547 1522 aa46.67■■■■■ 5.06
NOP16-204ENST00000504821 IFT140Q96RY7 1462 aa46.66■■■■■ 5.06
NOP16-204ENST00000504821 ABCC8Q09428 1581 aa46.64■■■■■ 5.06
NOP16-204ENST00000504821 TRIM41Q8WV44 630 aa46.6■■■■■ 5.05
NOP16-204ENST00000504821 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.52■■■■■ 5.04
NOP16-204ENST00000504821 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
NOP16-204ENST00000504821 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
NOP16-204ENST00000504821 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
NOP16-204ENST00000504821 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.99
NOP16-204ENST00000504821 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.13■■■■■ 4.981e-7■■■■■ 51
NOP16-204ENST00000504821 SOGA1O94964 1423 aa46.02■■■■■ 4.96
NOP16-204ENST00000504821 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.01■■■■■ 4.96
NOP16-204ENST00000504821 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46■■■■■ 4.95
NOP16-204ENST00000504821 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46■■■■■ 4.95
NOP16-204ENST00000504821 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46■■■■■ 4.95
NOP16-204ENST00000504821 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
NOP16-204ENST00000504821 CHD1O14646 1710 aa45.94■■■■■ 4.95
NOP16-204ENST00000504821 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.93■■■■■ 4.94
NOP16-204ENST00000504821 CUX1P39880 1505 aa45.89■■■■■ 4.94
NOP16-204ENST00000504821 FBLN2P98095 1184 aa45.89■■■■■ 4.94
NOP16-204ENST00000504821 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
NOP16-204ENST00000504821 ARHGEF11O15085 1522 aa45.87■■■■■ 4.93
NOP16-204ENST00000504821 WDR97A6NE52 1622 aa45.83■■■■■ 4.93
NOP16-204ENST00000504821 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.68■■■■■ 4.9
NOP16-204ENST00000504821 GRIN2BQ13224 1484 aa45.61■■■■■ 4.89
NOP16-204ENST00000504821 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
NOP16-204ENST00000504821 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
NOP16-204ENST00000504821 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.56■■■■■ 4.88
NOP16-204ENST00000504821 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.47■■■■■ 4.87
NOP16-204ENST00000504821 SYNJ1O43426 1573 aa45.45■■■■■ 4.87
NOP16-204ENST00000504821 PBRM1Q86U86 1689 aa45.44■■■■■ 4.87
NOP16-204ENST00000504821 SYNJ2O15056 1496 aa45.43■■■■■ 4.86
NOP16-204ENST00000504821 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.43■■■■■ 4.86
NOP16-204ENST00000504821 ARAP1Q96P48 1450 aa45.41■■■■■ 4.86
NOP16-204ENST00000504821 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.38■■■■■ 4.86
NOP16-204ENST00000504821 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.34■■■■■ 4.85
NOP16-204ENST00000504821 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.31■■■■■ 4.84
NOP16-204ENST00000504821 TOP2BQ02880 1626 aa45.23■■■■■ 4.83
NOP16-204ENST00000504821 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.23■■■■■ 4.83
NOP16-204ENST00000504821 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
NOP16-204ENST00000504821 GRIN2AQ12879 1464 aa45■■■■■ 4.79
NOP16-204ENST00000504821 ADAMTS12P58397 1594 aa44.99■■■■■ 4.79
NOP16-204ENST00000504821 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.9■■■■■ 4.78
NOP16-204ENST00000504821 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.88■■■■■ 4.78
NOP16-204ENST00000504821 NUP160Q12769 1436 aa44.83■■■■■ 4.77
NOP16-204ENST00000504821 CEP170Q5SW79 1584 aa44.81■■■■■ 4.76
NOP16-204ENST00000504821 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.66■■■■■ 4.74
NOP16-204ENST00000504821 SHROOM2Q13796 1616 aa44.61■■■■■ 4.73
NOP16-204ENST00000504821 JPH4Q96JJ6 628 aa44.42■■■■■ 4.7
NOP16-204ENST00000504821 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
NOP16-204ENST00000504821 KIF27Q86VH2 1401 aa44.4■■■■■ 4.7
NOP16-204ENST00000504821 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.34■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 242.3 ms