Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMTOR4Q0VGL1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMTOR4Q0VGL1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMTOR4Q0VGL1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMTOR4Q0VGL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms