Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPOCK1Q08629 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCK1Q08629 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPOCK1Q08629 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPOCK1Q08629 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms