Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRTAP1-1Q07627 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRTAP1-1Q07627 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms