Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX4Q06945 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX4Q06945 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX4Q06945 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOX4Q06945 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX4Q06945 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX4Q06945 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX4Q06945 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms