Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CALD1Q05682 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CALD1Q05682 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CALD1Q05682 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms