Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLOD1Q02809 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLOD1Q02809 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms