Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL18AQ02543 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL18AQ02543 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms