Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP3Q02447 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP3Q02447 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP3Q02447 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP3Q02447 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP3Q02447 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP3Q02447 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP3Q02447 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP3Q02447 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SP3Q02447 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SP3Q02447 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP3Q02447 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SP3Q02447 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP3Q02447 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP3Q02447 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP3Q02447 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP3Q02447 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP3Q02447 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP3Q02447 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP3Q02447 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP3Q02447 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SP3Q02447 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP3Q02447 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP3Q02447 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SP3Q02447 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP3Q02447 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP3Q02447 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP3Q02447 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP3Q02447 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP3Q02447 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP3Q02447 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP3Q02447 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP3Q02447 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP3Q02447 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP3Q02447 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP3Q02447 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP3Q02447 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SP3Q02447 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP3Q02447 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP3Q02447 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP3Q02447 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SP3Q02447 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SP3Q02447 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP3Q02447 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP3Q02447 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SP3Q02447 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SP3Q02447 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP3Q02447 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP3Q02447 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP3Q02447 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP3Q02447 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SP3Q02447 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SP3Q02447 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SP3Q02447 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP3Q02447 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SP3Q02447 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SP3Q02447 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SP3Q02447 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms