Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTD2P86397 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTD2P86397 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTD2P86397 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTD2P86397 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTD2P86397 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTD2P86397 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTD2P86397 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTD2P86397 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTD2P86397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTD2P86397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTD2P86397 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTD2P86397 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HTD2P86397 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTD2P86397 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HTD2P86397 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HTD2P86397 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTD2P86397 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTD2P86397 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTD2P86397 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTD2P86397 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTD2P86397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTD2P86397 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTD2P86397 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTD2P86397 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTD2P86397 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTD2P86397 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTD2P86397 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTD2P86397 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTD2P86397 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTD2P86397 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTD2P86397 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTD2P86397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTD2P86397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTD2P86397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTD2P86397 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTD2P86397 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms