Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD2P62316 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPD2P62316 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPD2P62316 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPD2P62316 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPD2P62316 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPD2P62316 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNRPD2P62316 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms