Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAG2P55895 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAG2P55895 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAG2P55895 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAG2P55895 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAG2P55895 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAG2P55895 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAG2P55895 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAG2P55895 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAG2P55895 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAG2P55895 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAG2P55895 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAG2P55895 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAG2P55895 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAG2P55895 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAG2P55895 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAG2P55895 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAG2P55895 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAG2P55895 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAG2P55895 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAG2P55895 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAG2P55895 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAG2P55895 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAG2P55895 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAG2P55895 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAG2P55895 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAG2P55895 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAG2P55895 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAG2P55895 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAG2P55895 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms