Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL28P46779 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL28P46779 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL28P46779 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL28P46779 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL28P46779 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL28P46779 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL28P46779 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL28P46779 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL28P46779 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL28P46779 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL28P46779 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL28P46779 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL28P46779 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL28P46779 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL28P46779 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL28P46779 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL28P46779 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL28P46779 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL28P46779 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL28P46779 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms