Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL3P39023 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL3P39023 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL3P39023 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3P39023 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3P39023 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL3P39023 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3P39023 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3P39023 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3P39023 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3P39023 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL3P39023 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3P39023 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3P39023 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL3P39023 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3P39023 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3P39023 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3P39023 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3P39023 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL3P39023 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3P39023 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3P39023 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3P39023 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3P39023 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL3P39023 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL3P39023 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL3P39023 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL3P39023 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3P39023 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3P39023 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3P39023 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3P39023 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL3P39023 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL3P39023 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3P39023 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3P39023 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3P39023 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3P39023 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3P39023 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL3P39023 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL3P39023 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms