Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A4P31645 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A4P31645 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A4P31645 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A4P31645 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.8 ms