Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXD10P28358 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXD10P28358 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD10P28358 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD10P28358 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD10P28358 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD10P28358 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD10P28358 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD10P28358 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD10P28358 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD10P28358 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms