Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMBRP28336 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NMBRP28336 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NMBRP28336 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NMBRP28336 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NMBRP28336 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMBRP28336 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMBRP28336 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMBRP28336 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMBRP28336 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMBRP28336 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMBRP28336 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMBRP28336 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMBRP28336 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMBRP28336 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMBRP28336 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NMBRP28336 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMBRP28336 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NMBRP28336 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMBRP28336 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NMBRP28336 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMBRP28336 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMBRP28336 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NMBRP28336 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMBRP28336 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMBRP28336 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMBRP28336 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMBRP28336 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMBRP28336 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMBRP28336 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NMBRP28336 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMBRP28336 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMBRP28336 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMBRP28336 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMBRP28336 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMBRP28336 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NMBRP28336 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMBRP28336 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMBRP28336 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMBRP28336 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBRP28336 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBRP28336 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBRP28336 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBRP28336 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBRP28336 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMBRP28336 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMBRP28336 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NMBRP28336 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMBRP28336 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMBRP28336 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMBRP28336 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMBRP28336 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMBRP28336 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMBRP28336 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMBRP28336 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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