Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GIFP27352 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIFP27352 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GIFP27352 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIFP27352 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIFP27352 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GIFP27352 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIFP27352 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GIFP27352 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIFP27352 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIFP27352 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIFP27352 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIFP27352 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIFP27352 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIFP27352 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GIFP27352 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIFP27352 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIFP27352 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIFP27352 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIFP27352 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIFP27352 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIFP27352 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIFP27352 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIFP27352 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIFP27352 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIFP27352 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIFP27352 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIFP27352 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIFP27352 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIFP27352 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIFP27352 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIFP27352 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIFP27352 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIFP27352 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIFP27352 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIFP27352 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIFP27352 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIFP27352 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIFP27352 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIFP27352 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIFP27352 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIFP27352 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIFP27352 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIFP27352 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GIFP27352 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIFP27352 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIFP27352 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIFP27352 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIFP27352 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GIFP27352 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GIFP27352 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIFP27352 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GIFP27352 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIFP27352 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIFP27352 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIFP27352 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GIFP27352 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GIFP27352 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GIFP27352 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms