Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PSMA4P25789 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA4P25789 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA4P25789 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms