Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN1P18031 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN1P18031 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN1P18031 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms