Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BMP4P12644 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP4P12644 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP4P12644 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP4P12644 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP4P12644 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP4P12644 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP4P12644 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP4P12644 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP4P12644 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP4P12644 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BMP4P12644 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP4P12644 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP4P12644 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP4P12644 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMP4P12644 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMP4P12644 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMP4P12644 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMP4P12644 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMP4P12644 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BMP4P12644 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BMP4P12644 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BMP4P12644 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BMP4P12644 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BMP4P12644 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMP4P12644 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BMP4P12644 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BMP4P12644 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BMP4P12644 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BMP4P12644 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP4P12644 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP4P12644 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP4P12644 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP4P12644 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP4P12644 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP4P12644 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP4P12644 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP4P12644 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP4P12644 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP4P12644 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP4P12644 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP4P12644 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP4P12644 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP4P12644 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms