Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
UQCRFS1P1P0C7P4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UQCRFS1P1P0C7P4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UQCRFS1P1P0C7P4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms