Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TPM2P07951 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM2P07951 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM2P07951 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM2P07951 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM2P07951 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM2P07951 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPM2P07951 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TPM2P07951 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TPM2P07951 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM2P07951 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM2P07951 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPM2P07951 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM2P07951 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM2P07951 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM2P07951 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM2P07951 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPM2P07951 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM2P07951 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM2P07951 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM2P07951 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TPM2P07951 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM2P07951 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM2P07951 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM2P07951 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TPM2P07951 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPM2P07951 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPM2P07951 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TPM2P07951 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPM2P07951 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPM2P07951 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM2P07951 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM2P07951 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPM2P07951 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM2P07951 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM2P07951 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM2P07951 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM2P07951 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM2P07951 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TPM2P07951 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPM2P07951 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM2P07951 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM2P07951 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM2P07951 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM2P07951 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TPM2P07951 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM2P07951 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM2P07951 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM2P07951 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM2P07951 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM2P07951 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPM2P07951 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM2P07951 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM2P07951 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPM2P07951 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM2P07951 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM2P07951 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM2P07951 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPM2P07951 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms