Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFMP07197 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFMP07197 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFMP07197 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFMP07197 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFMP07197 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFMP07197 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFMP07197 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFMP07197 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFMP07197 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFMP07197 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFMP07197 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFMP07197 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFMP07197 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFMP07197 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFMP07197 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFMP07197 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEFMP07197 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEFMP07197 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEFMP07197 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NEFMP07197 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFMP07197 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFMP07197 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFMP07197 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFMP07197 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFMP07197 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFMP07197 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFMP07197 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFMP07197 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFMP07197 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFMP07197 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFMP07197 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFMP07197 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFMP07197 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFMP07197 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFMP07197 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFMP07197 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFMP07197 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFMP07197 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFMP07197 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFMP07197 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFMP07197 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFMP07197 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFMP07197 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFMP07197 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFMP07197 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFMP07197 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFMP07197 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFMP07197 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFMP07197 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFMP07197 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFMP07197 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFMP07197 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFMP07197 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFMP07197 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFMP07197 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFMP07197 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFMP07197 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFMP07197 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFMP07197 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFMP07197 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFMP07197 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFMP07197 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFMP07197 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFMP07197 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFMP07197 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFMP07197 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFMP07197 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFMP07197 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFMP07197 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFMP07197 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
NEFMP07197 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEFMP07197 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEFMP07197 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NEFMP07197 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEFMP07197 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEFMP07197 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NEFMP07197 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEFMP07197 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFMP07197 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFMP07197 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFMP07197 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFMP07197 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFMP07197 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEFMP07197 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEFMP07197 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms