Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPBO95292 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPBO95292 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPBO95292 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPBO95292 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPBO95292 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPBO95292 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAPBO95292 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAPBO95292 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAPBO95292 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VAPBO95292 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VAPBO95292 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAPBO95292 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAPBO95292 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAPBO95292 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VAPBO95292 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAPBO95292 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VAPBO95292 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAPBO95292 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAPBO95292 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAPBO95292 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAPBO95292 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAPBO95292 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAPBO95292 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAPBO95292 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VAPBO95292 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VAPBO95292 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAPBO95292 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAPBO95292 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAPBO95292 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAPBO95292 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAPBO95292 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAPBO95292 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAPBO95292 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAPBO95292 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VAPBO95292 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAPBO95292 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VAPBO95292 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAPBO95292 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAPBO95292 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAPBO95292 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAPBO95292 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAPBO95292 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAPBO95292 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAPBO95292 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAPBO95292 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAPBO95292 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAPBO95292 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAPBO95292 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAPBO95292 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAPBO95292 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAPBO95292 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAPBO95292 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAPBO95292 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAPBO95292 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms