Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRATO95237 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRATO95237 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRATO95237 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRATO95237 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRATO95237 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRATO95237 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRATO95237 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRATO95237 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRATO95237 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRATO95237 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRATO95237 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRATO95237 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRATO95237 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRATO95237 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRATO95237 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRATO95237 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRATO95237 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRATO95237 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRATO95237 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRATO95237 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRATO95237 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRATO95237 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRATO95237 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRATO95237 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRATO95237 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRATO95237 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRATO95237 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRATO95237 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRATO95237 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRATO95237 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRATO95237 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRATO95237 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRATO95237 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRATO95237 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRATO95237 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRATO95237 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRATO95237 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRATO95237 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRATO95237 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRATO95237 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRATO95237 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRATO95237 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRATO95237 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRATO95237 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms