Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRDM1O75626 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM1O75626 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM1O75626 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM1O75626 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM1O75626 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms