Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40AO75400 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms