Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA5O60264 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMARCA5O60264 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA5O60264 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 622.8 ms