Protein–RNA interactions for Protein: O43612

HCRT, Orexin, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCRTO43612 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCRTO43612 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HCRTO43612 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCRTO43612 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HCRTO43612 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCRTO43612 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCRTO43612 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HCRTO43612 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HCRTO43612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HCRTO43612 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HCRTO43612 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCRTO43612 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCRTO43612 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCRTO43612 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HCRTO43612 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HCRTO43612 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HCRTO43612 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCRTO43612 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCRTO43612 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCRTO43612 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCRTO43612 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HCRTO43612 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HCRTO43612 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCRTO43612 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCRTO43612 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCRTO43612 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCRTO43612 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCRTO43612 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HCRTO43612 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HCRTO43612 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCRTO43612 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCRTO43612 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCRTO43612 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HCRTO43612 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCRTO43612 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCRTO43612 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCRTO43612 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCRTO43612 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCRTO43612 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCRTO43612 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCRTO43612 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCRTO43612 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCRTO43612 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HCRTO43612 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCRTO43612 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCRTO43612 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCRTO43612 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCRTO43612 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCRTO43612 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCRTO43612 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCRTO43612 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCRTO43612 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCRTO43612 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HCRTO43612 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCRTO43612 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCRTO43612 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCRTO43612 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HCRTO43612 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCRTO43612 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCRTO43612 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCRTO43612 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HCRTO43612 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCRTO43612 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCRTO43612 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms